История и культура еврейского Кёнигсберга находятся в центре внимания первой постоянной выставки музея в Калининградской синагоге. Здесь история европейского еврейства представлена через призму региона. В первом разделе, «Приезд», семь биографий описывают различные формы еврейской иммиграции литовских, польских и русских евреев в Кёнигсберг. Глава «Остаться» показывает Кёнигсберг с еврейской точки зрения с учетом особенностей портового и университетского города, а также его европейских связей.
Раздел «Изгнание» посвящен воспоминаниям учеников, которые посещали еврейскую школу при кёнигсбергской синагоге в 1935-1942 годах и, несмотря на неблагоприятные обстоятельства, были подготовлены к гордому еврейскому будущему здесь благодаря своим самоотверженным учителям. Световое колесо, с помощью которого посетитель может выбрать рассказы о людях и языки (русский, английский, немецкий, иврит), символизирует земной шар, по которому были рассеяны еврейские семьи Кёнигсберга.
Три угловатых острова в комнате, в которых находится секция «Уничтожение», намеренно нарушают атмосферу помещения. С помощью содержания, перенесенного в графические романы, они иллюстрируют разрыв цивилизации, произошедший здесь в результате депортации, принудительного труда и Холокоста. Основное внимание уделяется преступлениям, совершенным в регионе. На белом макете изображена первая депортация, а на другом острове посетители узнают, что на месте разрушенной синагоги находились бараки для еврейских подневольных рабочих. Третий остров рассказывает о марше смерти в Пальмникен.
Впервые в калининградском музейном ландшафте заполняются пробелы, связанные с историей евреев в городе и области и с европейской привязкой Кёнигсберга/Калининграда. Планируются дальнейшие части выставки, посвященные послевоенному периоду и истории калининградских евреев.
